Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rb1cc1Q9ESK9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rb1cc1Q9ESK9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms