Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DysfQ9ESD7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DysfQ9ESD7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms