Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk3Q9ERH7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms