Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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