Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dap3Q9ER88 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms