Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold3Q9EQ28 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms