Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf1Q9EPU0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Upf1Q9EPU0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf1Q9EPU0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf1Q9EPU0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms