Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPT1

Vmn1r63, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r63Q9EPT1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r63Q9EPT1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r63Q9EPT1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r63Q9EPT1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r63Q9EPT1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r63Q9EPT1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r63Q9EPT1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r63Q9EPT1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r63Q9EPT1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r63Q9EPT1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r63Q9EPT1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms