Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp1aQ9EPL5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp1aQ9EPL5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp1aQ9EPL5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp1aQ9EPL5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp1aQ9EPL5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp1aQ9EPL5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp1aQ9EPL5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp1aQ9EPL5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp1aQ9EPL5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp1aQ9EPL5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1aQ9EPL5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp1aQ9EPL5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms