Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD03

Rab13, Ras-related protein Rab-13, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab13Q9DD03 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab13Q9DD03 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab13Q9DD03 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms