Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufs3Q9DCT2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufs3Q9DCT2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms