Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt112Q9DCG9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms