Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pak1ip1Q9DCE5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms