Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf6Q9DBU5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf6Q9DBU5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms