Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc97Q9DBT3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms