Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg9Q9DB90 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Smg9Q9DB90 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg9Q9DB90 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg9Q9DB90 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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