Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms