Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms