Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
1700018B08RikQ9DA83 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms