Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc89Q9DA73 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc89Q9DA73 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc89Q9DA73 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms