Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Samd8Q9DA37 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd8Q9DA37 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms