Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms