Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgf29Q9DA08 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms