Protein–RNA interactions for Protein: Q9D991

1700123K08Rik, RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123K08RikQ9D991 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700123K08RikQ9D991 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
1700123K08RikQ9D991 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700123K08RikQ9D991 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700123K08RikQ9D991 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700123K08RikQ9D991 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700123K08RikQ9D991 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700123K08RikQ9D991 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700123K08RikQ9D991 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700123K08RikQ9D991 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700123K08RikQ9D991 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700123K08RikQ9D991 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700123K08RikQ9D991 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700123K08RikQ9D991 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms