Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8N1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8N1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8N1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8N1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8N1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms