Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms