Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpap3Q9D706 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpap3Q9D706 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms