Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbe1Q9D6Y9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms