Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G3

2900055J20Rik, RIKEN cDNA 2900055J20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900055J20RikQ9D6G3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms