Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms