Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ShpkQ9D5J6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms