Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Taf1dQ9D4V4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Taf1dQ9D4V4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Taf1dQ9D4V4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms