Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms