Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms