Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lonrf3Q9D4H7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lonrf3Q9D4H7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms