Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pabpc6Q9D4E6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc6Q9D4E6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms