Protein–RNA interactions for Protein: Q9D413

Sh2d6, SH2 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d6Q9D413 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d6Q9D413 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d6Q9D413 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d6Q9D413 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d6Q9D413 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d6Q9D413 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d6Q9D413 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms