Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms