Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc8Q9D2H8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Fndc8Q9D2H8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Fndc8Q9D2H8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Fndc8Q9D2H8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Fndc8Q9D2H8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Fndc8Q9D2H8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Fndc8Q9D2H8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Fndc8Q9D2H8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms