Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef12Q9D2F1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms