Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cthrc1Q9D1D6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cthrc1Q9D1D6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cthrc1Q9D1D6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cthrc1Q9D1D6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cthrc1Q9D1D6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cthrc1Q9D1D6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cthrc1Q9D1D6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cthrc1Q9D1D6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cthrc1Q9D1D6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cthrc1Q9D1D6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cthrc1Q9D1D6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cthrc1Q9D1D6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms