Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem53Q9D0Z3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem53Q9D0Z3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms