Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Pbdc1Q9D0B6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms