Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3bQ9CZT8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms