Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisa9Q9CZN4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa9Q9CZN4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms