Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms