Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bud23Q9CY21 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bud23Q9CY21 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms