Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl11Q9CXW4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl11Q9CXW4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms