Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms