Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY8

Rnaseh2a, Ribonuclease H2 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2aQ9CWY8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnaseh2aQ9CWY8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnaseh2aQ9CWY8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnaseh2aQ9CWY8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnaseh2aQ9CWY8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnaseh2aQ9CWY8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnaseh2aQ9CWY8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnaseh2aQ9CWY8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnaseh2aQ9CWY8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnaseh2aQ9CWY8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnaseh2aQ9CWY8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnaseh2aQ9CWY8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnaseh2aQ9CWY8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnaseh2aQ9CWY8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms